read_domain_example()
imports one of the bundled SDTM domain examples
as a tibble into R. See domain_example()
for
possible choices.
Arguments
- example
The name of SDTM domain example, e.g.
"cm"
(Concomitant Medication) or"ae"
(Adverse Events). Runread_domain_example()
for available example files.
Value
A tibble with an SDTM domain dataset, or a character vector of example file names.
Examples
# Leave the `example` parameter as missing for available example files.
read_domain_example()
#> [1] "ae" "apsc" "cm" "vs"
# Read the example Concomitant Medication domain.
read_domain_example("cm")
#> # A tibble: 7,510 × 21
#> STUDYID DOMAIN USUBJID CMSEQ CMSPID CMTRT CMDECOD CMINDC CMCLAS CMDOSE CMDOSU
#> <chr> <chr> <chr> <dbl> <chr> <chr> <chr> <chr> <chr> <dbl> <chr>
#> 1 CDISCP… CM 01-701… 1 1 ASPI… ACETYL… NA NERVO… 1 TABLET
#> 2 CDISCP… CM 01-701… 5 1 ASPI… ACETYL… NA NERVO… 1 TABLET
#> 3 CDISCP… CM 01-701… 9 1 ASPI… ACETYL… NA NERVO… 1 TABLET
#> 4 CDISCP… CM 01-701… 13 1 ASPI… ACETYL… NA NERVO… 1 TABLET
#> 5 CDISCP… CM 01-701… 18 1 ASPI… ACETYL… NA NERVO… 1 TABLET
#> 6 CDISCP… CM 01-701… 23 1 ASPI… ACETYL… NA NERVO… 1 TABLET
#> 7 CDISCP… CM 01-701… 28 1 ASPI… ACETYL… NA NERVO… 1 TABLET
#> 8 CDISCP… CM 01-701… 33 1 ASPI… ACETYL… NA NERVO… 1 TABLET
#> 9 CDISCP… CM 01-701… 38 1 ASPI… ACETYL… NA NERVO… 1 TABLET
#> 10 CDISCP… CM 01-701… 43 1 ASPI… ACETYL… NA NERVO… 1 TABLET
#> # ℹ 7,500 more rows
#> # ℹ 10 more variables: CMDOSFRQ <chr>, CMROUTE <chr>, VISITNUM <dbl>,
#> # VISIT <chr>, VISITDY <dbl>, CMDTC <chr>, CMSTDTC <chr>, CMENDTC <chr>,
#> # CMSTDY <dbl>, CMENDY <dbl>
# Read the example Adverse Events domain.
read_domain_example("ae")
#> # A tibble: 1,191 × 35
#> STUDYID DOMAIN USUBJID AESEQ AESPID AETERM AELLT AELLTCD AEDECOD AEPTCD AEHLT
#> <chr> <chr> <chr> <dbl> <chr> <chr> <chr> <dbl> <chr> <dbl> <chr>
#> 1 CDISCP… AE 01-701… 1 E07 APPLI… APPL… NA APPLIC… NA HLT_…
#> 2 CDISCP… AE 01-701… 2 E08 APPLI… APPL… NA APPLIC… NA HLT_…
#> 3 CDISCP… AE 01-701… 3 E06 DIARR… DIAR… NA DIARRH… NA HLT_…
#> 4 CDISCP… AE 01-701… 3 E10 ATRIO… AV B… NA ATRIOV… NA HLT_…
#> 5 CDISCP… AE 01-701… 1 E08 ERYTH… ERYT… NA ERYTHE… NA HLT_…
#> 6 CDISCP… AE 01-701… 2 E09 ERYTH… LOCA… NA ERYTHE… NA HLT_…
#> 7 CDISCP… AE 01-701… 4 E08 ERYTH… ERYT… NA ERYTHE… NA HLT_…
#> 8 CDISCP… AE 01-701… 1 E04 APPLI… APPL… NA APPLIC… NA HLT_…
#> 9 CDISCP… AE 01-701… 2 E05 APPLI… APPL… NA APPLIC… NA HLT_…
#> 10 CDISCP… AE 01-701… 1 E08 APPLI… APPL… NA APPLIC… NA HLT_…
#> # ℹ 1,181 more rows
#> # ℹ 24 more variables: AEHLTCD <dbl>, AEHLGT <chr>, AEHLGTCD <dbl>,
#> # AEBODSYS <chr>, AEBDSYCD <dbl>, AESOC <chr>, AESOCCD <dbl>, AESEV <chr>,
#> # AESER <chr>, AEACN <chr>, AEREL <chr>, AEOUT <chr>, AESCAN <chr>,
#> # AESCONG <chr>, AESDISAB <chr>, AESDTH <chr>, AESHOSP <chr>, AESLIFE <chr>,
#> # AESOD <chr>, AEDTC <chr>, AESTDTC <chr>, AEENDTC <chr>, AESTDY <dbl>,
#> # AEENDY <dbl>